En un mundo donde solo las mujeres pueden pilotar los Infinite Stratos, una anomalía irrumpe en la realidad establecida. Archer, un guerrero marcado por innumerables batallas y un pasado envuelto en cenizas y acero, despierta en un lugar desconocido. Su llegada no es casualidad; un IS ha reaccionado a su presencia, desafiando todas las reglas existentes.
Forzado a integrarse en la Academia IS como el segundo hombre capaz de pilotar estas máquinas de combate, Archer oculta su verdadera naturaleza mientras busca respuestas. ¿Por qué Alaya lo envió aquí? ¿Qué conexión existe entre los IS y su propia existencia? Mientras tanto, su mera presencia altera el equilibrio del mundo, atrayendo la atención de poderosos enemigos y de mentes brillantes como Tabane Shinonono.
Enfrentado a batallas, conspiraciones y un inesperado desarrollo romántico, Archer tendrá que decidir si este mundo merece su acero... o si, al final, solo quedarán espadas.