Shinichi sonunda Kara Örgütü çökertmiş ve eski bedenine geri dönmüş, Haibara ise Miyano Shio olarak Profesor Agase'nin yanında çalışmaya başlamıştır... Ne yazık ki Shinichi sınıfa gelen yeni öğrenci ile hayatının tekrar ve tamamen değişeceğinden habersizdir... - Peki bu yeni öğrenci kim ? - Shinchi ile ilişkileri ne olucak ?