La mabu Nika acude a la Catedral Memorial buscando ayuda para resolver sus problemas con su novio Nei, quien siente que le ocultan cosas. Es recibido por Anamnesis y el Profesor Zazel, quienes engañosamente le dan un poder elemental insertándole una rosa negra en el pecho. Nika jurando venganza contra Nei e Ika, es liberada al mundo exterior con el poder de la oscuridad. Mientras tanto, Spyro llega tarde a su clase con Snap Shot en la academia Skylanders en la Isla Oceana, donde tiene algunos contra tiempos debido a que es su segundo día. Debe adaptarse a la vida como un simple cadete más aún que no quiera, durante la clase de química del Maestro Pop Fizz tiene un contratiempo donde él y su compañero Drakos un wyvern terminan volando por los aires, estos despiertan en la enfermería tras haber sido tratados y curados, estos han estado inconscientes por un rato. Sin embargo, aparece el director de la Academia Skylanders, El maestro Eon reprochándole lo ocurrido en el laboratorio y dándoles un castigo.
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