Hyakkimaru ha decidido encontrarse a sí mismo en un nuevo viaje en el que Dororo no lo acompañará, las razones son inciertas, pero ambos corazones laten al ritmo del mismo sentimiento, los recuerdos no abandonan, te hacen revivir los mejores y peores momentos, los más tristes o felices, los recuerdos que crearon juntos son la fuerza para seguir adelante de cada uno, aunque lejos, los dos recorren el mismo sendero. Mientras Dororo reconstruye las ruinas que quedó de Daigo, cumpliendo el deseo más anhelado de sus padres siguiendo la nobleza y los ideales de su corazón, la codicia de quienes quieren ser los dueños y señores del nuevo territorio fundado dejará a prueba la fortaleza y sabiduría adquirida durante años de trabajo duro. En su búsqueda Hyakkimaru conoce a un joven monje que presta sus servicios de exorcismo y purificación para ganarse la vida, tras varios viajes juntos, en los cuales Hyakkimaru decidió evitar que se derrame sangre en vano y valorar la vida por sobre todas las cosas. Rumores y malos entendidos hacen que ellos crucen las tierras malditas de Daigo, donde un inesperado reencuentro da un giro completo a sus vidas para siempre.
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