Una enemiga del pasado regresa desde las sombras con el fin de resolver asuntos pendientes, esta vez acompañada de entrenadores enigmáticos y Pokémons poderosos. Nuestros héroes, los Dexholders de Kanto (acompañados con el domador de dragones) tendrán que volver a viajar por la región que comenzó todo, con el fin de fortalecer a sus equipos y derrocar a estos nuevos malhechores. [Historia ubicada después del final de Pokémon Special - Gold/Silver/Crystal] [Disclaimer: gran parte de los personajes aqui son propiedad de The Pokémon Company Int, Nintendo®, Game Freak Inc, Creatures Inc y TV Tokyo Corp.]