Seorang Profesor Gila, Menciptakan sebuah mesin waktu. Karna melakukan percobaan tanpa izin,Ia ditangkap oleh pemerintah. Lalu, Shinichi dan Shiho yang sudah kembali kewujud semulanya,Membantu menyelidiki tentang mesin itu. Tak sengaja, Shinichi memencet sebuah tombol bewarna Merah dan Ia tiba tiba menghilang... Kemana perginya Dia???