Cuando Michelangelo muere abriendo el portal esperaba quedar muerto pero es sorprendido apareciendo en un nuevo mundo donde otras tortugas como ellos protegen una versión de Nueva york de una amplia gama de enemigos. Intentando encontrarle un sentido a una vida sin sus hermanos se ve envuelto en las batallas que estas versiones jóvenes de su familia tienen a diario y su dinámica familiar. Cuando energías conocidas comienzan a emerger y enemigos de su pasado amenazan esta dimensión Mikey debe unir fuerzas con las jóvenes tortugas y sus amigos para evitar que lo que le paso a su mundo se repita en este. Quizás así encuentre la paz.
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