La storia è incentrata intorno a Narumi Fujishima, uno studente di scuola superiore che non trova particolare interesse nella scuola al punto da non ricordare i nomi dei suoi compagni di classe. Tuttavia, in una catena di eventi, egli entra a far parte del "Club di giardinaggio" della sua scuola i cui membri consistono nella sola Ayaka Shinozaki, compagna di classe di Narumi. Egli successivamente entra a far parte dell'agenzia NEET, un'agenzia di detective dilettante formata da disoccupati, NEET e disadattati sociali che si impegnano a risolvere piccoli casi su commissione, aiutati spesso da una branca della Yakuza. L'agenzia NEET è guidata da Alice, un'infantile ragazzina affetta dal disturbo di hikikomori. Alice non lascia mai la sua stanza, arredata solo da monitor per computer e animali impagliati. Grazie alle sue abilità di hacker, utilizzate in tutti i casi trattati, detiene la fama di grande detective nel mondo dell'investigazione. Durante tutto il corso della storia, Narumi, accompagnato da altri membri dell'agenzia, risolve i crimini e gli omicidi attraverso le risorse limitate a disposizione e al fine intelletto di Alice.
