Rebecca est apprentie chez monsieur Belmonde, un excentrique horloger qui lui apprend à utiliser son pouvoir. Quand il disparaît mystérieusement, seule la grande horloge liée à sa magie indique qu'il est encore en vie. Derrière lui, il n'a laissé qu'un indice : un ancien carnet de voyage, où il demande à son futur assistant de trouver un artefact qu'il a caché. Pour comprendre la vérité, Rebecca doit s'allier à un ennemi d'enfance, devenu conducteur de train, pour parcourir le pays. À bord du Colossus, ils se lancent dans une course contre la montre afin de remonter les traces du passé mystérieux de monsieur Belmonde, quitte à découvrir des secrets qui pourraient les mettre en danger.
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